Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- lamines:start [2013/12/13 17:31] – zaragosi
+++ lamines:start [2015/02/03 12:05] (Version actuelle) – zaragosi
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-==== Comptage semi-automatique des lamines ====
+===== Comptage semi-automatique des lamines =====
-Logiciels nécessaires : Photoshop, Excel et ImageJ (disponible [[http://rsb.info.nih.gov/ij/|ici]]
+Logiciels nécessaires : Photoshop, Excel et ImageJ (disponible [[http://rsb.info.nih.gov/ij/|ici]])
-=== Partie 1 sous Photoshop ===
+==== Partie 1 sous Photoshop ====
 Sous Photoshop ouvrez les fichier rX sources en 16 bits.
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 Enregistrer au format .tif
-=== Partie 2 sous ImageJ ===
+==== Partie 2 sous ImageJ ====
 Ouvrez l'image dans ImageJ (le drag & drop fonctionne).
 Vérifiez que la taille de l'image est la bonne (c'est écrit en haut de l'image).
+Faire un seuillage automatique pour passer en noir et blanc **Image - Adjust - Threshold - Auto - Apply**.
 Définissez les analyses à effectuer : **Analyses - Set measurements**.
+Sélectionner "centroïd"
 {{:lamines:2013-12-13_17h16_32.png?300|}}
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 Répétez la manipulation pour chaque tronçon.
-=== Partie 3 sous Excel ===
+==== Partie 3 sous Excel ====
 Compilez le tout sous Excel en mettant les bonnes cotes aux valeurs BY de chaque tronçon.
-BY = base de l'ellipse
+Y = centre de l'ellipse
 Height = épaisseur de l'ellipse